论文查重软件在论文修改中的指导价值主要体现在以下几个方面：首先，通过查重软件可以帮助作者及时发现和纠正论文中的重复内容，避免因为抄袭而被检测出来；其次，查重软件可以帮助作者检查论文中的语法错误、拼写错误等问题，提高论文的整体质量；此外，查重软件还可以为作者提供修改建议，指导作者如何更好地修改论文，使其更加完善。总的来说，论文查重软件在论文修改中的指导价值不可忽视。

在使用论文查重软件进行论文修改时，作者应该注意的是并非所有的重复内容都是抄袭，有些内容可能是合理引用或者是学术常识。因此，在修改论文时，作者需要结合查重软件的结果进行综合分析，判断哪些部分需要修改，哪些部分可以保留。此外，查重软件虽然可以帮助作者发现问题，但并不能完全取代人工修改，作者仍需对论文进行逐字逐句的审查，确保修改的准确性和合理性。综上所述，论文查重软件在论文修改中的指导价值是为作者提供参考和指导，但最终修改的责任仍在作者自身。